La SOPACI tiene como uno de sus principales objetivos fomentar la actividad científica en diferentes modalidades.
Los Congresos de Cirugía se realizan en forma bi-anual y convocan a una gran cantidad de cirujanos de Paraguay y de la región, mediante la presencia de invitados de primer nivel en los diferentes campos de la cirugía.
Las jornadas científicas se realizan al menos una vez al mes y no solamente en la capital sino tambien en diferentes ciudades del país con la intención de acercar la SOPACI a sus socios del interior. Diversos cursos se realizan con invitados nacionales y extranjeros y en diferentes servicios de cirugía del país.
Es el deseo de la SOPACI no solamente mantener el nivel y la frecuencia de las actuales actividades científicas, sino buscar el mejoramiento gradual de las mismas en términos de organización y calidad.